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mRNA测序在检测基因表达的同时，还能够获取mRNA结构信息、识别可变剪切位点和cSNP突变、解析RNA编辑，从而获得更全面的mRNA信息。

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MiSeq测序系统采用Illumina成熟的TruSeq边合成边测序技术，它是唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪，每次运行最多能产生超过7 Gb的数据。

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数字基因表达谱分析（Digital Gene Expression Tag  Profiling，DGE）是直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况。通过高通量测序一次可产生1千万个以上mRNA标签，可准确检测低丰度基因转录

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转录组（transcriptom）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合；狭义上指所有mRNA的集合。

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外显子组序列捕获及第二代测序是一种新型的基因组分析技术：外显子序列捕获芯片（或溶液）可在同一张芯片上以高特异性和高覆盖率捕获研究者感兴趣的目标外显子区域。

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Illumina公司的Solexa测序技术是一次运行就能产生数百亿到数千亿高质量碱基的革命性化学方法，这种技术的成本不足毛细管测序千分之一。Solexa测序技术运用了微阵列技术和专有的可逆终止子技术，

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